با توجه به مردمی بودن و عدم بهره مندی از پشتیبانی های رایج مستمر دولتی، مؤسسه بیت الاحزان حضرت زهرا (سلام الله علیها) از بدو تأسیس با مشکلات مالی، مکانی و کمبودها مواجه بوده است و بنای خود را برحمایت از طرح های خلاقانه و ایده های نو جهت پیشرفت قرار داده است.